1. Maltský obchodní registr
Malta je největší lodní registr v Evropě s více než 10 000 zaregistrovanými plavidly a je na bílé listině EU a Pařížského memoranda (Paris MoU) — vlajka, kterou už uznávají věřitelé, klasifikační společnosti i přístavní státní kontrola po celém světě.
2. Klasifikace a zákonná certifikace
Obchodní loď prochází prohlídkou klasifikační společnosti a nese zákonné certifikáty vyžadované jejím typem a oblastí plavby navíc ke klasifikační prohlídce — kombinaci, kterou správa vlajky kontroluje před dokončením registrace.
3. ISM, ISPS a MLC 2006
Vedle registrace komerční lodi stojí tři mezinárodní kodexy souladu: Kodex ISM pro bezpečnostní řízení, Kodex ISPS pro bezpečnost lodi a přístavu a MLC 2006 pro pracovní a životní podmínky námořníků. Každý má vlastní cyklus auditů a certifikace.
4. Nejprve prozatímní, poté trvalá registrace
Stejný dvoufázový postup jako u jakéhokoli plavidla: nejprve prozatímní registrace, poté trvalá registrace po dokončení měření tonáže a povinných prohlídek.
5. Hypotéky
Maltská zákonná lodní hypotéka je zavedeným, k věřitelům vstřícným nástrojem, což je jeden z důvodů, proč jsou věřitelé ochotni financovat plavidla pod maltskou vlajkou.
6. Přeflagování obchodního plavidla
Přeflagování lodi následuje stejný postup výmazu a registrace jako u jakéhokoli plavidla, přičemž klasifikační společnost a zákonné certifikáty se přenášejí nebo obnovují podle požadavků nové klasifikace a vlajky.
7. Tonážová daň
Komerční plavidla mohou splňovat podmínky pro zacházení tonážovou daní namísto standardní korporátní daně z příjmu z lodní dopravy — způsobilost se posuzuje případ od případu podle struktury a činnosti provozovatele.