1. שימוש פרטי ושימוש מסחרי אינם אותה שאלה
יאכטה המשמשת רק את בעליה נמצאת במעמד מע"מ שונה מזו המופעלת באופן מסחרי לצ'רטר, ושתיהן מוערכות תחת כללים שונים — משטר הרישום וטיפול המע"מ קשורים אך אינם אותה החלטה.
2. היכן עובר הגבול בפועל
קו הגבול הוא השימוש, לא המראה: יאכטה הנושאת מדי פעם אורחים בתשלום אינה מטופלת כמו כזו שלעולם לא עושה זאת, ומעבר ממצב אחד לאחר משנה את מעמד המע"מ יחד עם משטר הרישום.
3. חברת הבעלים או המפעילה חשובה
רישום ודיווח מע"מ שייכים לישות משפטית, לא לכלי השיט עצמו, וזו אחת הסיבות שמבנה הבעלות בדרך כלל מוסדר לפני רישום כלי השיט ולא אחריו.
4. מפעילי צ'רטר ומע"מ
מפעיל המשכיר בצ'רטר יאכטה הרשומה באופן מסחרי זקוק בדרך כלל לרשום את אותה ישות למע"מ על הכנסות הצ'רטר, לצד ההסמכה המסחרית של כלי השיט עצמו.
5. מס טונאז' הוא שאלה נפרדת
מפעילים מסחריים עשויים להיות מוערכים בנפרד לטיפול מס טונאז' על הכנסות שילוח. הדבר מוערך באופן עצמאי מהמע"מ, מול קריטריוני זכאות משלו.
6. הסדירו זאת לפני הרישום, לא אחריו
שינוי מבנה הבעלות או מעמד המע"מ לאחר שכלי השיט כבר רשום הוא בדרך כלל משבש יותר מאשר הסדרת שניהם מראש — ולכן אנו שואלים על השימוש המיועד לפני פתיחת תיק הרישום.