1. Start med fartøjet, ikke papirarbejdet
Registret behandler en lystyacht, en mindre båd og et handelsskib forskelligt, og forskellen fastsættes af brug og størrelse frem for af, hvad ejeren kalder fartøjet. At finde ud af, hvilken af de tre fartøjet reelt er, afgør hvilket synsforløb, hvilke certifikater og hvilken tidslinje der gælder.
2. Lyst eller erhverv ændrer alt nedstrøms
Uafhængigt af fartøjstype registreres et fartøj, der kun bruges af ejeren, til lystbrug; et fartøj, der drives mod betaling — charter, fragt, passagerer — registreres erhvervsmæssigt og bærer den certificering, der hører med. De to ordninger er ikke ombyttelige uden at konvertere registreringen.
3. Størrelse og tonnage fastsætter certificeringsforløbet
Et lille, privat brugt fartøj medfører en proportional syns- og dokumentmappe. Når et fartøj er stort nok til at kræve tonnagemåling, eller drives erhvervsmæssigt, gælder hele sættet af lovpligtige syn og certifikater. Dette vurderes fartøj for fartøj, ikke ud fra en fast længderegel alene.
4. Ejerskab står over alle tre
Uanset fartøjstype afhænger ejerskabsvejen af ejerens status: en berettiget ejer registrerer direkte eller via et maltesisk eller godkendt udenlandsk selskab med en bosiddende agent i Malta. Et maltesisk ejerselskab er almindeligt, hvor ejere ønsker adskilt ansvar og en overdragelse af aktier i stedet for en overdragelse af fartøjet ved salg, men det er ikke obligatorisk for alle.
5. Registrering i to trin gælder på tværs af hele linjen
Først midlertidig registrering, derefter endelig registrering, når syn og måling er afsluttet — samme forløb for en jolle, en superyacht og et handelsskib, kun synenes omfang ændrer sig.
6. Allerede flaget et andet sted?
Omflagning fungerer på samme måde uanset fartøjstype: det udgående register sletter fartøjet, Malta registrerer det, og de to sekventeres, så tiden uden flag minimeres.
7. Hvad der følger efter registrering, varierer efter klasse
En privat brugt båds løbende forpligtelser er lettere end en erhvervsyachts, som igen er lettere end et handelsskibs ISM-, ISPS- og MLC 2006-cyklusser. Fornyelseskalenderen fastsættes ved endelig registrering, tilpasset fartøjets klasse.