1. Yksityinen vai kaupallinen: päätä ensin
Vain omistajansa ja hänen vieraidensa käyttämä jahti rekisteröidään huvikäyttöön. Jahti, joka kuljettaa maksavia vieraita tai jota muuten liikennöidään korvausta vastaan, rekisteröidään kaupallisesti ja sertifioidaan sen mukaisesti. Myöhempi muuttaminen on mahdollista mutta häiritsevää, joten tämä kannattaa ratkaista rehellisesti ennen kuin tiedosto avataan.
2. Yksityisen jahdin rekisteröinti
Rekisterin kevyin reitti: yksityiskäyttöön suhteutettu katsastus ja sertifiointi, eikä lainkaan charter- tai miehistösertifiointia kannettavana.
3. Kaupallinen jahti tuo mukanaan Commercial Yacht Coden
Kaupallisesti liikennöity jahti sertifioidaan Commercial Yacht Coden mukaisesti tai, 12 metrin ja alle 24 metrin runkopituisille jahdeille enintään 12 matkustajalla, Small Commercial Yacht Coden mukaisesti. Nämä määrittävät turvallisuusvarustuksen, miehistön ja katsastuksen tason, joka jahdilta vaaditaan, ennen kuin se voi laillisesti kuljettaa maksavia vieraita.
4. Omistusyhtiö
Rekisteröinti maltalaisen yhtiön kautta on yleistä molemmissa säännöstöissä silloin, kun se sopii omistajalle: se antaa kelpoisen maltalaisen omistajan, pitää aluksen vastuut erillään omistajan muusta omaisuudesta ja tekee myöhemmästä myynnistä osakkeiden siirron. Se ei ole pakollista jokaiselle omistajalle.
5. ALV seuraa käyttöä, ei lippua
Yksityistä ja kaupallista käyttöä kohdellaan ALV:n kannalta eri tavoin, ja asema riippuu omistusrakenteesta ja siitä, miten jahtia tosiasiallisesti käytetään — tämä vahvistetaan kyseiselle alukselle erikseen, ei oleteta rekisteröintityypin perusteella.
6. Aikataulu
Väliaikainen rekisteröinti myönnetään, kun hakemus ja asiakirjat ovat täydelliset ja hyväksytty; pysyvä rekisteröinti seuraa, kun mittaus ja sovellettavat katsastukset on suoritettu.
7. Olemassa olevan jahdin siirtäminen Maltan lipun alle
Muualla jo rekisteröity jahti uudelleenlippuutetaan sen sijaan, että aloitettaisiin alusta: poistotodistus lähtevältä rekisteriltä, ajoitettuna Maltan väliaikaisen rekisteröinnin kanssa niin, että mahdollinen aikaväli jää mahdollisimman lyhyeksi.