1. Zmena vlajky je postupnosť krokov, nie začínanie odznova
Väčšina toho, čo zmena vlajky potrebuje, už existuje: vlastnícky titul, história prehliadok, niekedy hypotéka. Práca spočíva v naplánovaní výstupu z pôvodného registra oproti maltskej registrácii tak, aby plavidlo nikdy nezostalo bez platnej vlajky.
2. Osvedčenie o výmaze
Pôvodný register musí formálne vymazať plavidlo zo svojho registra — to je zvyčajne pomalšia polovica zmeny vlajky, a tá, ktorú nová správa vlajky kontroluje najmenej, čo je dôvod, prečo sa žiadosť o výmaz podáva ako prvá.
3. Minimalizovanie medzery
Predbežná registrácia umožňuje naplánovať obe strany zmeny vlajky spoločne, takže plavidlo môže prejsť z jednej vlajky na druhú s čo najmenším prerušením, aké postupy oboch registrov dovoľujú.
4. Ak existuje existujúca hypotéka
Hypotéka automaticky nenasleduje plavidlo na nový register. Jej prevod si vyžaduje súhlas hypotekárneho veriteľa, ktorý sa zvyčajne získava súbežne so žiadosťou o výmaz, nie až po nej.
5. Čo sa prenáša a čo sa obnovuje
Niektoré doklady sa aktualizujú namiesto opätovného vydania — doklad o vlastníckom titule opätovne vydaný na meno novej vlajky. Iné sa získavajú nanovo výslovne pre zmenu vlajky, predovšetkým samotné osvedčenie o výmaze, ktoré z podstaty veci nemôže existovať pred zmenou vlajky.
6. Chyba, ktorá stojí najviac času
Neskoré začatie žiadosti o výmaz z pôvodného registra, po tom, čo je maltská strana už pripravená, je najčastejšou príčinou toho, že zmena vlajky trvá dlhšie, než musela — vstupujúca strana býva len zriedka úzkym miestom.