1. เริ่มจากตัวเรือ ไม่ใช่เอกสาร
ทะเบียนปฏิบัติต่อเรือยอชท์เพื่อการพักผ่อน เรือเล็ก และเรือเดินทะเลเชิงพาณิชย์แตกต่างกัน โดยความแตกต่างนี้กำหนดจากการใช้งานและขนาด มากกว่าจะเป็นสิ่งที่เจ้าของเรียกเรือลำนั้นว่าอะไร การพิจารณาว่าเรือของท่านเข้าข่ายประเภทใดในสามประเภทนี้ จะเป็นตัวกำหนดแนวทางการตรวจเรือ ใบรับรอง และระยะเวลาที่เกี่ยวข้อง
2. ส่วนบุคคลหรือเชิงพาณิชย์เปลี่ยนแปลงทุกอย่างที่ตามมา
ไม่ว่าจะเป็นเรือประเภทใด เรือที่ใช้งานโดยเจ้าของเท่านั้นจะจดทะเบียนเพื่อการพักผ่อน ส่วนเรือที่ดำเนินการเพื่อรับค่าตอบแทน — เช่าเหมาลำ สินค้า ผู้โดยสาร — จะจดทะเบียนเชิงพาณิชย์และมีการรับรองที่เกี่ยวข้อง ทั้งสองระบบนี้ไม่สามารถใช้แทนกันได้โดยไม่ผ่านการเปลี่ยนแปลงการจดทะเบียน
3. ขนาดและระวางบรรทุกกำหนดแนวทางการรับรอง
เรือขนาดเล็กที่ใช้งานส่วนตัวมีเอกสารการตรวจเรือตามสัดส่วนที่เหมาะสม เมื่อเรือมีขนาดใหญ่พอที่ต้องมีการวัดขนาดตันเรือ หรือดำเนินการเชิงพาณิชย์ ชุดการตรวจเรือและใบรับรองตามกฎหมายเต็มรูปแบบจะมีผลบังคับใช้ ซึ่งประเมินเป็นรายลำ ไม่ใช่จากกฎเกณฑ์ความยาวคงที่เพียงอย่างเดียว
4. ความเป็นเจ้าของอยู่เหนือทั้งสามประเภท
ไม่ว่าเรือจะเป็นประเภทใด เส้นทางความเป็นเจ้าของขึ้นอยู่กับสถานะของเจ้าของ เจ้าของที่มีคุณสมบัติเหมาะสมจดทะเบียนโดยตรง หรือผ่านบริษัทมอลตาหรือบริษัทต่างประเทศที่ได้รับอนุมัติพร้อมตัวแทนที่พำนักในมอลตา บริษัทเจ้าของเรือของมอลตาเป็นที่นิยมเมื่อเจ้าของต้องการแยกความรับผิดและโอนหุ้นแทนการโอนตัวเรือเมื่อมีการขาย แต่ไม่ใช่ข้อบังคับสำหรับทุกราย
5. การจดทะเบียนสองขั้นตอนใช้กับทุกประเภท
การจดทะเบียนชั่วคราวก่อน ตามด้วยการจดทะเบียนถาวรเมื่อการตรวจเรือและการวัดขนาดเสร็จสมบูรณ์ — ลำดับเดียวกันสำหรับเรือยางท้ายเรือ ซูเปอร์ยอชท์ และเรือเดินทะเลเชิงพาณิชย์ เพียงแต่ขอบเขตการตรวจเรือจะเปลี่ยนไป
6. ชักธงประเทศอื่นอยู่แล้วหรือไม่?
การเปลี่ยนธงทำงานเหมือนกันไม่ว่าจะเป็นเรือประเภทใด ทะเบียนเดิมถอนทะเบียนเรือออก มอลตาจดทะเบียนเรือ และทั้งสองขั้นตอนจัดลำดับเพื่อลดเวลาที่เรือไม่มีธงให้น้อยที่สุด
7. สิ่งที่ตามมาหลังการจดทะเบียนแตกต่างกันตามประเภท
ข้อผูกพันต่อเนื่องของเรือเล็กที่ใช้งานส่วนตัวเบากว่าของเรือยอชท์เชิงพาณิชย์ ซึ่งเบากว่ารอบ ISM, ISPS และ MLC 2006 ของเรือเดินทะเลเชิงพาณิชย์ ปฏิทินการต่ออายุจะถูกกำหนดขึ้นเมื่อมีการจดทะเบียนถาวร และปรับตามประเภทของเรือ